داستان بازی از سال 1994 زمانی که ژاپن مورد حمله آمریکا قرار گرفته بود شروع می‌شود و در ابتدا بازی در تاریکی شب با چند قایق در حال حرکت به اردوگاه دشمن هستید، اما در بین راه ناگهان دشمن متوجه حضور شما می‌شود و شما مورد حمله دشمن قرار می‌گیرید و مجبور به فرار به خشکی می‌شوید و از اینجا است که شما کنترل کامل کاراکتر را بر عهده می‌گیرید و یک درگیری بین شما و نیروهای دشمن رخ می‌دهد، شما بعد از طی کردن مسیر سوار یک کشتی می‌شوید و از منطقه فرار می‌کنید.

اما بعد از گذشتن چند ثانیه صدای انفجار مهیبی می آید و نور همه جار فرا می‌گیرد و در عرض چند ثانیه همه چیز نابود می‌شود از اینجا بازی از زمان 1994 یک پرش به زمان مدرن می‌زند و از اینجا گروه بد کامپانی (bad company) در اختیار شما قرار می‌گیرد، بازی دارای صحنه‌های سینمایی زیادی است که به وسیله آنها داستان بازی پیش می‌رود.